Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TBCCD1Q9NVR7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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