Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CEP44Q9C0F1 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms