Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms