Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPIN3Q9BQK8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms