Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ZNF479Q96JC4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms