Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNFT2Q96EX2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms