Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms