Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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