Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SYCNQ0VAF6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms