Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms