Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMF1P82094 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMF1P82094 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMF1P82094 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms