Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
H2BFSP57053 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms