Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSCP56915 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GSCP56915 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms