Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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