Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTGFP29279 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms