Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms