Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PEX2P28328 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PEX2P28328 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PEX2P28328 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PEX2P28328 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms