Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms