Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms