Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGFR3P22607 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGFR3P22607 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms