Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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