Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC115619.1-201ENST00000567376 1605 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 IL25-202ENST00000397242 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 C21orf140-201ENST00000410005 756 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PSMD10P1-201ENST00000436861 681 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LSMEM1-202ENST00000439068 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC009800.1-201ENST00000511357 1006 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC012038.1-201ENST00000551279 552 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 BOLA2P2-202ENST00000604904 567 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PLAC8-201ENST00000311507 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LECT2-201ENST00000274507 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms