Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC192P0DO97 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms