Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC172P0C7W6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms