Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SERPINC1P01008 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SERPINC1P01008 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms