Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC1O14908 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms