Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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