Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TRIM17Q9Y577 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM17Q9Y577 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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