Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAF6Q9Y4K3 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms