Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
UBE2D4Q9Y2X8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms