Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL11Q9NVR0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL11Q9NVR0 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms