Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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