Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms