Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms