Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMBRD2Q68DH5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms