Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SRSF5Q13243 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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