Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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