Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPAQ06546 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms