Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CALD1Q05682 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CALD1Q05682 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms