Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC42EP1Q00587 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms