Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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FAM3AP98173 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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FAM3AP98173 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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FAM3AP98173 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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FAM3AP98173 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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FAM3AP98173 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FAM3AP98173 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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