Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IRX4P78413 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IRX4P78413 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX4P78413 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX4P78413 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX4P78413 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IRX4P78413 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms