Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPM4P67936 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPM4P67936 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPM4P67936 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPM4P67936 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms