Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms