Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RWDD2BP57060 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RWDD2BP57060 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RWDD2BP57060 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RWDD2BP57060 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RWDD2BP57060 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RWDD2BP57060 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RWDD2BP57060 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RWDD2BP57060 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RWDD2BP57060 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms