Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC3P51654 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC3P51654 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GPC3P51654 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms