Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC020909.3-201ENST00000598194 375 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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