Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms