Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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HOXD10P28358 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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