Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ITGA3P26006 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms